Şehirdeki Doğabilimci (Şehri Bilimsel Oyun Alanınız Haline Nasıl Getirirsiniz?) – Menno Schilthuizen

5. Bölüm: Sanal Akademi

Leiden’deki doğa tarihi müzesine, Japonya’dan gelen ve Gobiidae ya da kaya balığı ailesi konusunda uzman olan dost canlısı bir topluluk bilim insanı olan Akihito, düzenli olarak ziyaretlerde bulunurdu. Akihito’nun balık koleksiyonumuzu incelemek için bu kadar uzaklardan gelmesinin nedeni, Leiden müzesinin Japonya’dan gelen çok önemli tarihi örneklere, yani holotiplere veya evrensel referans örneklerine sahip olmasıydı. Bunlar, 1820’lerde, o zamanlar sıkı bir izolasyonist dış politika sürdüren Japonya’da çalışmasına izin verilen tek Avrupalı olan Hollandalı zoolog Philipp von Siebold tarafından toplanmış ve alkolde korunmuştu.

Akihito, topluluk bilimi geçmişi olan Tokyo merkezli bir aileden geliyor: babası kabuklularla ilgileniyordu ve Akihito’nun küçük erkek kardeşi kuşları inceliyor. Oldukça zengin oldukları için, Akihito ve akrabaları, Tokyo’nun eski şehir merkezindeki aile evlerinde kendi zooloji laboratuvarlarını işletiyorlar. Sadece bu da değil, Ichthyological Research veya Gene gibi prestijli bilimsel dergilerde, tek üyelik bilgisi olarak ev adreslerini kullanarak -ki bu alışılmadık bir durumdur- makaleler de yayınlıyorlar.

Şimdi, Akihito muhtemelen bunu yapabiliyor çünkü ev adresi tesadüfen şu: İmparatorluk Konutu, 1-1 Chiyoda, Chiyoda-ku, Tokyo 100-0001, Japonya. Çünkü Akihito, Japonya’nın emekli imparatorundan başkası değil; gerçi bizim müzemizin koridorlarında ona ve silahlı koruma ordusuna rastlamamız, onun hala veliaht prens olduğu ve yengeç inceleyen babası Hirohito’nun imparator olduğu zamanlardan kalma. Ancak daha az itibarlı birçok topluluk bilim insanı, sonuçlarını yayınlamaya çalıştıklarında engellerle karşılaşıyor çünkü yerleşik bilimsel dergilerin çoğu, yazarların bir kurum adresine sahip olmasını gerektiriyor.

Bilgelik Havuzları

“Yayınla ya da yok ol”, daha iyi bilinen akademik özdeyişlerden biridir ve geleneksel akademik bilimde olduğu kadar topluluk biliminde de geçerlidir: keşiflerinizi dünyaya anlatmanız gerekir. Neden mi? Çünkü bilim, tek başına takıntılı kişiler tarafından yapılsa bile, büyük ölçüde sosyal bir girişimdir. Bilginin, fikirlerin ve sonuçların, bilimin dolaşım sisteminde engelsiz bir şekilde akması gerekir ki herkes, Newton’un deyişiyle, “devlerin omuzlarında durarak” daha ileriyi görebilsin. Bilim bir bütün olarak böyle ilerler. Bulgularınızı kendinize saklarsanız, bilime hiçbir faydası olmaz ve keşifleriniz hiç yapılmamış sayılabilir.

Bu yüzden bilim insanları, profesyonel ve profesyonel olmayanlar, keşiflerini belgelemek zorundadırlar ve bunu yapmanın en yaygın yolu hala kısa bir bilimsel makale veya “bildiri” şeklindedir. Bazı makaleler güzel yazılmış olsa da, esasen daha küçük veya daha büyük bir bilimsel keşifler setinin standartlaştırılmış raporlarıdır. Tipik “GMAY” (Giriş, Materyal ve Yöntemler, Sonuçlar, Tartışma) formatı, çalışmanın arka planının açıklandığı bir Giriş ile başlar, ardından tam olarak ne yaptığınızı ve nasıl yaptığınızı anlattığınız “Materyal ve Yöntemler” başlıklı bir bölüm gelir, böylece herkes yaklaşımınızın doğru olup olmadığını kontrol edebilir ve isterse çalışmanızı tekrarlayabilir. Ardından bulguların kuru, tarafsız bir şekilde, herhangi bir abartı veya tefsir olmaksızın sunulduğu bir “Sonuçlar” bölümü gelir. Sonra, nihayet sonuçlarınızın ne anlama geldiğini düşündüğünüzü söyleme şansını bulduğunuz “Tartışma” bölümü gelir. Bir özet veya “Sonuçlar” bölümü gibi bazı çevresel bölümler olabilir ve sayılarla dolu uzun tablolar içeren ekler ve tabii ki diğer yayınlara yapılan referansların bir listesi olabilir, ama özünde, her bilimsel makale böyle görünür.

İçeriklerinin tekdüzeliği göz önüne alındığında, bu makalelerin yayınlandığı bu kadar çok farklı derginin olması şaşırtıcıdır: dünya çapında tam 30.000 tane. Bu, büyük ölçüde, bilimsel yayınların basılı dergilerde çıktığı ve her derginin özel, hatta aşırı özel bir araştırmacı topluluğuna hizmet ettiği zamandan kalma bir mirastır. Eğer nematod solucanları üzerinde çalışan bir Rus biyolog olsaydınız, Russian Journal of Nematology’ye abone olurdunuz. Pasifik’in tatlı su faunasıyla ilgilenen bir limnolog, muhtemelen New Zealand Journal of Marine and Freshwater Research’ün son sayısını kaçıramazdı, Batı Afrika’da çalışan bir botanikçi ise düzensiz olarak çıkan Études sur la Flore et la Végétation du Burkina Faso et des Pays Avoisinants’a yemin ederdi. Daha genel veya teorik bir ilgiye sahip ekologlar Ecology, the Journal of Ecology ve Plant Ecology’yi okurdu. Bazen bu dergiler akademik topluluklar tarafından yayınlanırdı, ancak genellikle büyüyen küresel bilim insanları, öğrenciler ve üniversite kütüphaneleri topluluğuna abonelik satan ticari yayıncıların elindeydi.

Ve bazı yayıncılar, bilimi kanını kurutana kadar sömürmek için yayınla-ya-da-yok-ol zorunluluğunu kötüye kullanırdı. Bilim insanlarının alanlarındaki güncel gelişmeleri takip etmek için dergilere erişmesi gerekiyordu. Bu yüzden kişisel bir abonelik alırlar veya üniversite kütüphanelerinin bir tane satın almasını sağlarlardı, bu da genellikle yılda binlerce veya gerçekten takip etmeniz gereken en iyi dergiler için on binlerce dolara mal olurdu. Ama tek maliyet bu değil. Bilim insanları arasında favori bir anekdot, akademik olmayan arkadaşlarına veya akrabalarına makalelerinin bir bilimsel dergide yayınlanacağını söylediklerinde aldıkları tepkidir. “Vay, harika!” der arkadaşları. “Sana ne kadar ödüyorlar?” Çünkü ticari dergilerin ve gazetelerin aksine, bilimsel dergiler (çok daha küçük bir baskı sayısına sahip olan) yazarlarına ödeme yapmaz ve sık sık onlardan sayfa ücreti alırlar. Makaleniz yayınlandığında, dergi size makale başına binlerce dolara varabilen “yayın ücretleri” için bir fatura gönderir.

Makalenizin yayınlandığı “zaman” dedim, ama “eğer” demeliyim. Bilimsel dergiler bir hakem değerlendirme sürecine dayanır. Bir dergiye bir makale gönderdiğinizde ve editörün yayın için kabul edip etmeyeceğini sorduğunuzda, editör onu makalenizin girdiği bilim alanında uzman olan iki veya daha fazla hakeme gönderir. Hakemlerin fikirlerini söylemelerine izin vermek ve bir sonraki konferansta yumruklaşmaları önlemek için, değerlendirmeler genellikle anonimdir. Yine de, bazı bilim alanları o kadar küçüktür ve meslektaşların takıntıları o kadar iyi bilinir ki, gelen değerlendirmeye dayanarak hakemin kimliğini kolayca tahmin edebilirsiniz. Bir keresinde bir editör yanlışlıkla bana kendi yazdığım bir makale için hakem olmamı istedi—bazı alanlar o kadar küçüktür. Hakemlerin söylediklerine bağlı olarak, makaleniz reddedilebilir (bazı en iyi dergilerde bu, zamanın %95’ine kadar olur) veya önce onu gözden geçirip iyileştirmeniz istenebilir. Bu tüm hakem değerlendirme, düzenleme ve yayınlama süreci kolayca bir yıldan fazla sürebilir. Ancak yayıncılar tüm bu iş için asla ödeme yapmaz çünkü düzenleme ve hakemlik, genellikle bilimsel topluluklarına bir hizmet olarak ücretsiz olarak bilim insanları tarafından yapılır.

Bilim insanının (genellikle vergi mükelleflerinin parasıyla ödenen) ticaret tarafından üç kez ücretlendirildiği bu yayıncılık sistemi, elektronik yayıncılık mümkün olduğundan ve fiziksel dağıtımlarıyla basılı dergiler artık bir zorunluluk olmaktan çıktığından beri ortadan kalkma yolundadır. 2000’lerin başında, sistemin sapkınlığından iyice bıkmış olan bilim insanları, kamu parasıyla büyük kapsamlı bilimsel yayıncılık platformları başlatarak ticari yayıncıları devre dışı bırakmaya başladılar. Bunlar hala dergi olarak adlandırılıyor ve hala hakem değerlendirme sistemini kullanıyorlar, ancak esasen herkesin ihtiyaç duyduğu şeyi arayıp bulabileceği devasa çevrimiçi bilimsel makale havuzlarıdır. Ve herkes derken, gerçekten herkesi kastediyorum. Bu sözde “açık erişim” hareketi, bilimsel sonuçları akademi içinde ve dışında herkesin ücretsiz olarak erişimine sunmayı amaçlamaktadır.

Örneğin, elektronik dergi PeerJ, 2012’deki kuruluşundan bu yana, biyoloji ve tıp alanında yaklaşık 20.000 makalenin gün ışığına çıkmasına yardımcı oldu. Bunlara herkesin erişmesi, indirmesi ve paylaşması ücretsizdir. PeerJ’de çalışan yirmi iki kişinin hala maaş alması gerekiyor, bu yüzden yazara bir kerelik bir yayın ücreti alınıyor, ama hepsi bu. Ödeme duvarı yok, abonelik ücreti yok.

Bu açık erişimli dergilere ek olarak, birçok başka girişim de açık erişim devriminden önce yayınlanan veya hala geleneksel ticari olarak işleyen bilimsel dergilerin azalan sayısında yayınlanmakta olan bilimsel literatürü ücretsiz olarak erişilebilir kılıyor. Yüzyıllar öncesine dayanan klasik doğa tarihi kitaplarını ve dergilerini dijitalleştiren Biyoçeşitlilik Miras Kütüphanesi (Biodiversity Heritage Library) var. Tüm bilimlerden daha yeni dergiler için aynı şeyi yapan JStor var. Birinin bir yerlerde çevrimiçi olarak koyduğu herhangi bir makalenin bir pdf’sini bulacak olan Google Scholar var. Hatta, yasal olarak bir ödeme duvarının arkasında olması gereken, çoğunlukla ticari yayıncılardan 88 milyon bilimsel makale bulabileceğiniz Sci-Hub gibi korsan web siteleri bile var. Sci-Hub’ı tek başına kuran ve yöneten akademik Robin Hood olan genç Kazak nörobiyolog Alexandra Elbakyan için, bilimsel bilgiye ücretsiz erişim ve getirdiği faydalar, telif hakkının kısıtlayıcı yasalarından daha önemliydi. Ve sonra, biyologların henüz hakem değerlendirmesinden geçmemiş veya yayınlanmamış ancak yazarların mümkün olan en kısa sürede erişilebilir kılmak istedikleri, ya diğer bilim insanlarının içerikten haberdar olması gerektiğini düşündükleri için ya da iyileştirme için öneriler almak istedikleri için yerleştirdikleri makale taslakları olan “ön baskıları” koydukları BioRxiv (biyo-arşiv olarak telaffuz edilir) var.

Açık erişimin bilimin demokratikleşmesi için yarattığı farkı abartmak zordur. Örneğin, 2000’lerin başında Malezya’da çalıştığımda, ülkenin sakin bir ücra köşesindeki fakir, yeni kurulmuş üniversitemin kütüphanesi sadece bir avuç yerel dergiyi karşılayabiliyordu ve çoğu ana akım bilimsel literatürden kopuktuk. Ancak açık erişim geldiğinde, meslektaşlarım ve ben nihayet en son yayınlara herkes gibi engelsiz erişim sağlayabildik. Ve COVID-19 salgını sırasında, sadece ücretli tıp profesyonellerinin değil, herkesin bilimsel yayınları ilk elden nasıl kontrol edebildiğini, iyi ya da kötü, gördük.

Veri Dağları

Açık erişimin ardından açık veri devrimi geldi. Geçmişte, bilimsel çalışmaların dayandığı ham veriler atılır veya kimsenin erişemeyeceği masa çekmecelerinde veya üniversite dosya dolaplarında saklanır, on yıllar sonra bir bölüm temizliği sırasında atılırdı. Bugün çoğu bilimsel kurumun ve topluluk bilim insanının benimsediği açık veri devrimi, bu ham verilerin (notlar, ölçümler, görüntüler, çıktılar—bilimsel çalışmaların dayandığı tüm bilgi iplikçikleri) dijital olarak kamuya açık ve kalıcı olarak erişilebilir bir yere yatırılması gerektiğini dikte eder.

Örneğin, biyoçeşitlilik verileri—Smithsonian Enstitüsü koleksiyonundaki etiketlerden transkriptler kadar, Patje Debeuf’un güve gözlemleri de—Küresel Biyoçeşitlilik Bilgi Tesisi (GBIF) gibi açık veri bankalarına yatırılır, burada herkes tarafından, herhangi bir zamanda, anında ve ücretsiz olarak alınabilirler. Sigrid Jakob’un mutfak tezgahı laboratuvarında ürettiği o sonsuz A, C, G ve T dizileri olan genetik veriler, GenBank’ta saklanır. GenBank ana sayfasına gidip arama kutusuna “Sigrid” yazarak, orada ürettiği ve yatırdığı uzun DNA dizileri listesini hızla almak sadece saniyeler sürer. Onun rastgele bir girişine tıklıyorum ve 31 Ekim 2022’de Staten Island’da örneklediği Entoloma carolinianum mantarından yaklaşık bin DNA harfinden oluşan bir dizi ortaya çıkıyor. Kayıt ayrıca, bir resim ve örneğin büyüdüğü tam konumu (High Rock Park’taki Orbach Gölü kıyısı) yerleştirdiği iNaturalist’e olan bağlantıyı da belirtiyor. O bağlantıya giderseniz, Jakob’un başlangıçta onu farklı bir mantar cinsi olan Hygrophorus’un bir üyesi olarak tanımladığını, ancak başka bir iNaturalist kullanıcısı olan Stephen Russell’ın (The Essential Guide of Cultivating Mushrooms’un yazarı) doğru tanımı sağladığını ve bunun daha sonra Jakob tarafından benimsenip üçüncü bir kullanıcı olan Batı Pennsylvania Mantar Kulübü’nden John Plischke tarafından ikinci kez onaylandığını görebilirsiniz. Ve kim bilir, bir gün başka biri bu ve benzeri verileri indirip derleyerek, örneğin mantarların şehir parklarını nasıl kolonize ettiğini veya meyve veren cisimlerin ortaya çıktığı yılın zamanının iklim değişikliğiyle nasıl değiştiğini inceleyebilir.

Tüm bu veri ve fikir akışı, bilimsel veriler atılsaydı, kilit altında tutulsaydı, ödeme duvarlarının arkasına gizlenseydi veya bağlantısız ve parçalanmış olsaydı mümkün olmazdı. Literatüre ve verilere açık erişimle, kendi kendine inşa edilmiş ev laboratuvarlarındaki veya topluluk atölyelerindeki topluluk bilim insanları, diğer bilim insanlarıyla, ister profesyonel ister sıradan olsun, ve üniversitelerindeki ve araştırma enstitülerindeki ücretli bilim insanları kadar bilimin daha büyük dünyasıyla bağlantılıdır. Ve literatür ve veri, bilimsel girişimi güçlendiren yakıt iken, motoru doğru soruları sormak ve cevapları anlamaktır. Ve işte burada MOOC’lar devreye giriyor.

Kitlesel açık çevrimiçi kurslar 2012’de (“MOOC Yılı” olarak adlandırılan) başladı ve o zamandan beri büyüdü. Bunlar, geniş veya özel bir konuda çevrimiçi kurslardır ve herkes tarafından katılabilirler. Video dersleri, alıştırmalar, diğer öğrenciler ve öğretim görevlileriyle etkileşim kurmak için forumlar ve ilginizi çeken herhangi bir bilimsel alanı kavramak için ihtiyaç duyacağınız diğer tüm materyaller vardır. MOOC platformu Coursera’da, arama terimini—örneğin “mikrobiyoloji”—yazmanız yeterlidir ve dünyanın dört bir yanından üniversiteler, müzeler ve şirketler tarafından sunulan bir sürü ücretsiz mikroorganizma kursu ortaya çıkar. “Evrim” terimini yazarsanız, bulacağınız MOOC’lardan biri, birkaç yıl önce iki meslektaşım ve benim kurduğum ve şimdi yaklaşık on bin kişi tarafından alınan “Evrim Bugün”dür—bu, otuz yıldır öğretmenlik yapmaya başladığımdan beri tüm üniversite derslerimdeki toplam öğrenci sayısından çok daha fazladır.

Ve Coursera genel amaçlı bir site iken, Barselona merkezli Transmitting Science platformunda, biyoçeşitlilik ve ekoloji meraklılarına daha yönelik bir çevrimiçi kurs koleksiyonu bulabilirsiniz, buna bir doğa tarihi koleksiyonu oluşturma ve yönetme kursları da dahildir. Ve bu iyi bir haber çünkü, bir sonraki bölümde göreceğimiz gibi, örnek toplamak bir şehirdeki doğabilimci olmanın temel bir bileşenidir.